prediction of hbsag conformational changes in iranian patients with occult hepatitis b infection with bioinformatics tools

عفونت نهفته بیماری هپاتیت b به عنوان عفونت با dna hbv قابل شناسایی و آنتی‏ژن سطحی hbsag غیرقابل شناسایی در خون بیماران است. عقیده بر این است که شناسایی ویروس هپاتیت b به وسیله میزبان در منطقه a از آنتی ژن سطحی (hbsag) انجام می‏شود. اما به دلیل فقدان ساختار سه بعدی hbsag، مدرکی برای این فرضیه وجود ندارد. پیشگویی ساختار سه بعدی توالی موتان یافته و وحشی از توالی اولیه، تغییرات ساختاری را آشکار می‏کند. این مطالعه به منظور بررسی تغییرات ساختاری hbsag در حالت نهفته و وحشی در نمونه‏های ایرانی است. توالی hbsag در بیماران ایرانی مبتلا به عفونت نهفته و بارز از بانک ژن استخراج شد. پیشگویی ساختار 3 بعدی با استفاده از مدلسازی از نو و متد l-tasser انجام شد. سپس با استفاده از spdbv مشاهده شد. ممان دوقطبی توسط نرم افزار chimera انجام شد. هر دو توالی وحشی و موتان برای پیشگویی مناطق آنتی‏ژنیک در نرم‏افزار clc main workbenech بررسی شد. نتایج نشان داد که موتان در حالت نهفته باعث تغییر درخواص ساختاری آن می‏شود. این تغییر در شاخص آنتی‏ژنیک و ممان دوقطبی ساختار سه بعدی پیشگویی‏شده نشان داده شده است. یافته‏های این مطالعه تأکید می‏کند که علاوه بر موتاسیون در منطقه a، موتاسیون‏های دیگری هم می‏توانند باعث تغییر ساختاری hbsag شوند. پس در شناسایی و طراحی واکسن باید به ساختار سه بعدی hbsag توجه کرد.